Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5X7

EIF4E3, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4E3Q8N5X7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF4E3Q8N5X7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF4E3Q8N5X7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EIF4E3Q8N5X7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EIF4E3Q8N5X7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4E3Q8N5X7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4E3Q8N5X7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EIF4E3Q8N5X7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF4E3Q8N5X7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF4E3Q8N5X7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4E3Q8N5X7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4E3Q8N5X7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4E3Q8N5X7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4E3Q8N5X7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4E3Q8N5X7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4E3Q8N5X7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4E3Q8N5X7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF4E3Q8N5X7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4E3Q8N5X7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF4E3Q8N5X7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF4E3Q8N5X7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4E3Q8N5X7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4E3Q8N5X7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4E3Q8N5X7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF4E3Q8N5X7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF4E3Q8N5X7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF4E3Q8N5X7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF4E3Q8N5X7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4E3Q8N5X7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF4E3Q8N5X7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF4E3Q8N5X7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF4E3Q8N5X7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms