Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GPC2Q8N158 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GPC2Q8N158 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GPC2Q8N158 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GPC2Q8N158 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GPC2Q8N158 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
GPC2Q8N158 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GPC2Q8N158 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
GPC2Q8N158 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
GPC2Q8N158 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
GPC2Q8N158 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
GPC2Q8N158 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
GPC2Q8N158 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GPC2Q8N158 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GPC2Q8N158 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
GPC2Q8N158 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GPC2Q8N158 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GPC2Q8N158 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
GPC2Q8N158 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GPC2Q8N158 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GPC2Q8N158 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GPC2Q8N158 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GPC2Q8N158 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GPC2Q8N158 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GPC2Q8N158 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GPC2Q8N158 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GPC2Q8N158 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GPC2Q8N158 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GPC2Q8N158 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GPC2Q8N158 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GPC2Q8N158 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GPC2Q8N158 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GPC2Q8N158 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GPC2Q8N158 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GPC2Q8N158 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GPC2Q8N158 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GPC2Q8N158 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
GPC2Q8N158 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GPC2Q8N158 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GPC2Q8N158 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GPC2Q8N158 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
GPC2Q8N158 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GPC2Q8N158 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GPC2Q8N158 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GPC2Q8N158 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GPC2Q8N158 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GPC2Q8N158 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GPC2Q8N158 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GPC2Q8N158 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
GPC2Q8N158 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GPC2Q8N158 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GPC2Q8N158 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GPC2Q8N158 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GPC2Q8N158 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GPC2Q8N158 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
GPC2Q8N158 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GPC2Q8N158 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GPC2Q8N158 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GPC2Q8N158 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GPC2Q8N158 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
GPC2Q8N158 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
GPC2Q8N158 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GPC2Q8N158 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GPC2Q8N158 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GPC2Q8N158 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GPC2Q8N158 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
GPC2Q8N158 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms