Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNPY4Q8N129 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNPY4Q8N129 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNPY4Q8N129 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNPY4Q8N129 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNPY4Q8N129 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNPY4Q8N129 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNPY4Q8N129 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CNPY4Q8N129 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNPY4Q8N129 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNPY4Q8N129 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CNPY4Q8N129 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNPY4Q8N129 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNPY4Q8N129 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNPY4Q8N129 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNPY4Q8N129 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNPY4Q8N129 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNPY4Q8N129 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNPY4Q8N129 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNPY4Q8N129 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNPY4Q8N129 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNPY4Q8N129 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNPY4Q8N129 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNPY4Q8N129 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNPY4Q8N129 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNPY4Q8N129 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNPY4Q8N129 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNPY4Q8N129 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNPY4Q8N129 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNPY4Q8N129 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNPY4Q8N129 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CNPY4Q8N129 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNPY4Q8N129 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNPY4Q8N129 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNPY4Q8N129 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNPY4Q8N129 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNPY4Q8N129 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNPY4Q8N129 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNPY4Q8N129 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms