Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXM3

MRPL41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL41Q8IXM3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL41Q8IXM3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL41Q8IXM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL41Q8IXM3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL41Q8IXM3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL41Q8IXM3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL41Q8IXM3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL41Q8IXM3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL41Q8IXM3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL41Q8IXM3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL41Q8IXM3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL41Q8IXM3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL41Q8IXM3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL41Q8IXM3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL41Q8IXM3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL41Q8IXM3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL41Q8IXM3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL41Q8IXM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL41Q8IXM3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL41Q8IXM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL41Q8IXM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL41Q8IXM3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL41Q8IXM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL41Q8IXM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL41Q8IXM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL41Q8IXM3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL41Q8IXM3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL41Q8IXM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPL41Q8IXM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPL41Q8IXM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms