Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH8

CDH26, Cadherin-like protein 26, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH26Q8IXH8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH26Q8IXH8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH26Q8IXH8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH26Q8IXH8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH26Q8IXH8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH26Q8IXH8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH26Q8IXH8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH26Q8IXH8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH26Q8IXH8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH26Q8IXH8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH26Q8IXH8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH26Q8IXH8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH26Q8IXH8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH26Q8IXH8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH26Q8IXH8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH26Q8IXH8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms