Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIX1LQ8IVB5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIX1LQ8IVB5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIX1LQ8IVB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIX1LQ8IVB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIX1LQ8IVB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIX1LQ8IVB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIX1LQ8IVB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIX1LQ8IVB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIX1LQ8IVB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIX1LQ8IVB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIX1LQ8IVB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIX1LQ8IVB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIX1LQ8IVB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIX1LQ8IVB5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIX1LQ8IVB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIX1LQ8IVB5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIX1LQ8IVB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms