Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML1Q86YW5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML1Q86YW5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML1Q86YW5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML1Q86YW5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TREML1Q86YW5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TREML1Q86YW5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TREML1Q86YW5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TREML1Q86YW5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREML1Q86YW5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREML1Q86YW5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TREML1Q86YW5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TREML1Q86YW5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TREML1Q86YW5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TREML1Q86YW5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREML1Q86YW5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREML1Q86YW5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TREML1Q86YW5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TREML1Q86YW5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TREML1Q86YW5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TREML1Q86YW5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREML1Q86YW5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TREML1Q86YW5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TREML1Q86YW5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TREML1Q86YW5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TREML1Q86YW5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TREML1Q86YW5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TREML1Q86YW5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TREML1Q86YW5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TREML1Q86YW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TREML1Q86YW5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TREML1Q86YW5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TREML1Q86YW5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TREML1Q86YW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TREML1Q86YW5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TREML1Q86YW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TREML1Q86YW5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TREML1Q86YW5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TREML1Q86YW5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TREML1Q86YW5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms