Protein–RNA interactions for Protein: Q86VV8

RTTN, Rotatin, humanhuman

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTTNQ86VV8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTTNQ86VV8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTTNQ86VV8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTTNQ86VV8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTTNQ86VV8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTTNQ86VV8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTTNQ86VV8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTTNQ86VV8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTTNQ86VV8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTTNQ86VV8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTTNQ86VV8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTTNQ86VV8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTTNQ86VV8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTTNQ86VV8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTTNQ86VV8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTTNQ86VV8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTTNQ86VV8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTTNQ86VV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTTNQ86VV8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTTNQ86VV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTTNQ86VV8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTTNQ86VV8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTTNQ86VV8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTTNQ86VV8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTTNQ86VV8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTTNQ86VV8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTTNQ86VV8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTTNQ86VV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTTNQ86VV8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTTNQ86VV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTTNQ86VV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTTNQ86VV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTTNQ86VV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms