Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZD3Q86UT5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZD3Q86UT5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZD3Q86UT5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD3Q86UT5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD3Q86UT5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZD3Q86UT5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD3Q86UT5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZD3Q86UT5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZD3Q86UT5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZD3Q86UT5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZD3Q86UT5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZD3Q86UT5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZD3Q86UT5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZD3Q86UT5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZD3Q86UT5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDZD3Q86UT5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDZD3Q86UT5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDZD3Q86UT5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDZD3Q86UT5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZD3Q86UT5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZD3Q86UT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDZD3Q86UT5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZD3Q86UT5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZD3Q86UT5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD3Q86UT5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD3Q86UT5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD3Q86UT5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZD3Q86UT5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZD3Q86UT5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZD3Q86UT5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD3Q86UT5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD3Q86UT5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZD3Q86UT5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD3Q86UT5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZD3Q86UT5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZD3Q86UT5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD3Q86UT5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PDZD3Q86UT5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZD3Q86UT5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZD3Q86UT5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZD3Q86UT5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms