Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB3

ALPK2, Alpha-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK2Q86TB3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK2Q86TB3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK2Q86TB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALPK2Q86TB3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALPK2Q86TB3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALPK2Q86TB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALPK2Q86TB3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALPK2Q86TB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALPK2Q86TB3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALPK2Q86TB3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALPK2Q86TB3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALPK2Q86TB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK2Q86TB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK2Q86TB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK2Q86TB3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK2Q86TB3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK2Q86TB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK2Q86TB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALPK2Q86TB3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK2Q86TB3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK2Q86TB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms