Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM29Q86T20 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMIM29Q86T20 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM29Q86T20 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMIM29Q86T20 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMIM29Q86T20 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM29Q86T20 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM29Q86T20 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM29Q86T20 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM29Q86T20 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM29Q86T20 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM29Q86T20 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM29Q86T20 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM29Q86T20 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM29Q86T20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms