Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC49.19■■■■■ 5.46
CLASP1Q7Z460 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.15■■■■■ 5.46
CLASP1Q7Z460 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
CLASP1Q7Z460 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
CLASP1Q7Z460 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CLASP1Q7Z460 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.88■■■■■ 5.41
CLASP1Q7Z460 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
CLASP1Q7Z460 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
CLASP1Q7Z460 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.71■■■■■ 5.39
CLASP1Q7Z460 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
CLASP1Q7Z460 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC48.62■■■■■ 5.37
CLASP1Q7Z460 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC48.48■■■■■ 5.35
CLASP1Q7Z460 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CLASP1Q7Z460 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
CLASP1Q7Z460 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
CLASP1Q7Z460 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC48.21■■■■■ 5.31
CLASP1Q7Z460 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CLASP1Q7Z460 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CLASP1Q7Z460 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
CLASP1Q7Z460 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.02■■■■■ 5.28
CLASP1Q7Z460 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.97■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
CLASP1Q7Z460 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
CLASP1Q7Z460 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.26
CLASP1Q7Z460 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CLASP1Q7Z460 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
CLASP1Q7Z460 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
CLASP1Q7Z460 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.23
CLASP1Q7Z460 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.68■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CLASP1Q7Z460 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
CLASP1Q7Z460 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.55■■■■■ 5.2
CLASP1Q7Z460 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
CLASP1Q7Z460 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
CLASP1Q7Z460 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
CLASP1Q7Z460 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CLASP1Q7Z460 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CLASP1Q7Z460 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
CLASP1Q7Z460 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
CLASP1Q7Z460 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
CLASP1Q7Z460 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CLASP1Q7Z460 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CLASP1Q7Z460 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CLASP1Q7Z460 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms