Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC186Q7Z3E2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC186Q7Z3E2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC186Q7Z3E2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC186Q7Z3E2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC186Q7Z3E2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC186Q7Z3E2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC186Q7Z3E2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC186Q7Z3E2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC186Q7Z3E2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC186Q7Z3E2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC186Q7Z3E2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC186Q7Z3E2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC186Q7Z3E2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC186Q7Z3E2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC186Q7Z3E2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC186Q7Z3E2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC186Q7Z3E2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC186Q7Z3E2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC186Q7Z3E2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC186Q7Z3E2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC186Q7Z3E2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC186Q7Z3E2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC186Q7Z3E2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC186Q7Z3E2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC186Q7Z3E2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC186Q7Z3E2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC186Q7Z3E2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC186Q7Z3E2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC186Q7Z3E2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC186Q7Z3E2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC186Q7Z3E2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC186Q7Z3E2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC186Q7Z3E2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC186Q7Z3E2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC186Q7Z3E2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC186Q7Z3E2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC186Q7Z3E2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC186Q7Z3E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC186Q7Z3E2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC186Q7Z3E2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC186Q7Z3E2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC186Q7Z3E2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC186Q7Z3E2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC186Q7Z3E2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC186Q7Z3E2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC186Q7Z3E2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC186Q7Z3E2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC186Q7Z3E2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC186Q7Z3E2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC186Q7Z3E2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC186Q7Z3E2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC186Q7Z3E2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC186Q7Z3E2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC186Q7Z3E2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms