Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC80Q76M96 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC80Q76M96 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC80Q76M96 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC80Q76M96 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC80Q76M96 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC80Q76M96 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC80Q76M96 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC80Q76M96 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC80Q76M96 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC80Q76M96 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC80Q76M96 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC80Q76M96 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC80Q76M96 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC80Q76M96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC80Q76M96 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC80Q76M96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC80Q76M96 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC80Q76M96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC80Q76M96 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC80Q76M96 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC80Q76M96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC80Q76M96 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC80Q76M96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms