Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIAT1Q6ZQX7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIAT1Q6ZQX7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIAT1Q6ZQX7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIAT1Q6ZQX7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIAT1Q6ZQX7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIAT1Q6ZQX7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIAT1Q6ZQX7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIAT1Q6ZQX7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIAT1Q6ZQX7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIAT1Q6ZQX7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIAT1Q6ZQX7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIAT1Q6ZQX7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIAT1Q6ZQX7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIAT1Q6ZQX7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIAT1Q6ZQX7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIAT1Q6ZQX7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIAT1Q6ZQX7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIAT1Q6ZQX7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIAT1Q6ZQX7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIAT1Q6ZQX7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIAT1Q6ZQX7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIAT1Q6ZQX7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIAT1Q6ZQX7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIAT1Q6ZQX7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIAT1Q6ZQX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIAT1Q6ZQX7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms