Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIPAL3Q6P499 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NIPAL3Q6P499 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIPAL3Q6P499 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPAL3Q6P499 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIPAL3Q6P499 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIPAL3Q6P499 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIPAL3Q6P499 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NIPAL3Q6P499 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NIPAL3Q6P499 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NIPAL3Q6P499 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NIPAL3Q6P499 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NIPAL3Q6P499 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NIPAL3Q6P499 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPAL3Q6P499 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NIPAL3Q6P499 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NIPAL3Q6P499 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPAL3Q6P499 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL3Q6P499 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPAL3Q6P499 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL3Q6P499 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL3Q6P499 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPAL3Q6P499 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NIPAL3Q6P499 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NIPAL3Q6P499 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NIPAL3Q6P499 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPAL3Q6P499 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms