Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC144NLQ6NUI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC144NLQ6NUI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC144NLQ6NUI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC144NLQ6NUI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC144NLQ6NUI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144NLQ6NUI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC144NLQ6NUI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC144NLQ6NUI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC144NLQ6NUI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC144NLQ6NUI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144NLQ6NUI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms