Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CST9Q5W186 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CST9Q5W186 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CST9Q5W186 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CST9Q5W186 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CST9Q5W186 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CST9Q5W186 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CST9Q5W186 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CST9Q5W186 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CST9Q5W186 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CST9Q5W186 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CST9Q5W186 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CST9Q5W186 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CST9Q5W186 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
CST9Q5W186 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CST9Q5W186 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CST9Q5W186 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CST9Q5W186 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CST9Q5W186 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CST9Q5W186 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CST9Q5W186 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CST9Q5W186 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CST9Q5W186 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CST9Q5W186 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CST9Q5W186 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CST9Q5W186 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CST9Q5W186 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CST9Q5W186 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CST9Q5W186 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CST9Q5W186 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CST9Q5W186 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CST9Q5W186 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CST9Q5W186 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CST9Q5W186 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CST9Q5W186 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CST9Q5W186 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CST9Q5W186 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CST9Q5W186 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CST9Q5W186 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CST9Q5W186 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CST9Q5W186 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CST9Q5W186 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CST9Q5W186 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CST9Q5W186 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CST9Q5W186 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CST9Q5W186 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CST9Q5W186 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CST9Q5W186 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CST9Q5W186 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CST9Q5W186 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CST9Q5W186 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CST9Q5W186 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CST9Q5W186 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CST9Q5W186 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CST9Q5W186 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CST9Q5W186 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CST9Q5W186 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CST9Q5W186 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CST9Q5W186 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CST9Q5W186 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CST9Q5W186 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CST9Q5W186 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CST9Q5W186 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CST9Q5W186 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CST9Q5W186 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CST9Q5W186 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CST9Q5W186 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CST9Q5W186 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CST9Q5W186 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms