Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZFYVE27Q5T4F4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZFYVE27Q5T4F4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZFYVE27Q5T4F4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZFYVE27Q5T4F4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZFYVE27Q5T4F4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZFYVE27Q5T4F4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ZFYVE27Q5T4F4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZFYVE27Q5T4F4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZFYVE27Q5T4F4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ZFYVE27Q5T4F4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ZFYVE27Q5T4F4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ZFYVE27Q5T4F4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ZFYVE27Q5T4F4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZFYVE27Q5T4F4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZFYVE27Q5T4F4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZFYVE27Q5T4F4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZFYVE27Q5T4F4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ZFYVE27Q5T4F4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZFYVE27Q5T4F4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZFYVE27Q5T4F4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZFYVE27Q5T4F4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZFYVE27Q5T4F4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZFYVE27Q5T4F4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZFYVE27Q5T4F4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZFYVE27Q5T4F4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZFYVE27Q5T4F4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms