Protein–RNA interactions for Protein: Q5T197

DCST1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCST1Q5T197 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCST1Q5T197 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCST1Q5T197 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCST1Q5T197 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCST1Q5T197 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCST1Q5T197 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DCST1Q5T197 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCST1Q5T197 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DCST1Q5T197 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DCST1Q5T197 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCST1Q5T197 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCST1Q5T197 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCST1Q5T197 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCST1Q5T197 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCST1Q5T197 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCST1Q5T197 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCST1Q5T197 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCST1Q5T197 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCST1Q5T197 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCST1Q5T197 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCST1Q5T197 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DCST1Q5T197 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DCST1Q5T197 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DCST1Q5T197 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCST1Q5T197 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCST1Q5T197 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCST1Q5T197 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms