Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN3Q5JUX0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPIN3Q5JUX0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPIN3Q5JUX0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPIN3Q5JUX0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPIN3Q5JUX0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPIN3Q5JUX0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIN3Q5JUX0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPIN3Q5JUX0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPIN3Q5JUX0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIN3Q5JUX0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIN3Q5JUX0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIN3Q5JUX0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIN3Q5JUX0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPIN3Q5JUX0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPIN3Q5JUX0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPIN3Q5JUX0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPIN3Q5JUX0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPIN3Q5JUX0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPIN3Q5JUX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPIN3Q5JUX0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPIN3Q5JUX0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIN3Q5JUX0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIN3Q5JUX0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPIN3Q5JUX0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIN3Q5JUX0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIN3Q5JUX0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPIN3Q5JUX0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms