Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP78Q5JTW2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP78Q5JTW2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP78Q5JTW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP78Q5JTW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP78Q5JTW2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP78Q5JTW2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP78Q5JTW2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP78Q5JTW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP78Q5JTW2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP78Q5JTW2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP78Q5JTW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP78Q5JTW2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP78Q5JTW2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP78Q5JTW2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP78Q5JTW2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP78Q5JTW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP78Q5JTW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP78Q5JTW2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP78Q5JTW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP78Q5JTW2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP78Q5JTW2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP78Q5JTW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP78Q5JTW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP78Q5JTW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP78Q5JTW2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP78Q5JTW2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP78Q5JTW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP78Q5JTW2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP78Q5JTW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEP78Q5JTW2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEP78Q5JTW2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP78Q5JTW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms