Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RTL5Q5HYW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTL5Q5HYW3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RTL5Q5HYW3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RTL5Q5HYW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RTL5Q5HYW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RTL5Q5HYW3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
RTL5Q5HYW3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RTL5Q5HYW3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RTL5Q5HYW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RTL5Q5HYW3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RTL5Q5HYW3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RTL5Q5HYW3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RTL5Q5HYW3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RTL5Q5HYW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RTL5Q5HYW3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RTL5Q5HYW3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RTL5Q5HYW3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RTL5Q5HYW3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RTL5Q5HYW3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RTL5Q5HYW3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RTL5Q5HYW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RTL5Q5HYW3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RTL5Q5HYW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
RTL5Q5HYW3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RTL5Q5HYW3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RTL5Q5HYW3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RTL5Q5HYW3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RTL5Q5HYW3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTL5Q5HYW3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RTL5Q5HYW3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RTL5Q5HYW3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RTL5Q5HYW3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RTL5Q5HYW3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RTL5Q5HYW3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RTL5Q5HYW3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RTL5Q5HYW3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RTL5Q5HYW3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RTL5Q5HYW3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RTL5Q5HYW3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RTL5Q5HYW3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RTL5Q5HYW3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RTL5Q5HYW3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RTL5Q5HYW3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTL5Q5HYW3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RTL5Q5HYW3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTL5Q5HYW3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTL5Q5HYW3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RTL5Q5HYW3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RTL5Q5HYW3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RTL5Q5HYW3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RTL5Q5HYW3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RTL5Q5HYW3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RTL5Q5HYW3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RTL5Q5HYW3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RTL5Q5HYW3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RTL5Q5HYW3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RTL5Q5HYW3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RTL5Q5HYW3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RTL5Q5HYW3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RTL5Q5HYW3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RTL5Q5HYW3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RTL5Q5HYW3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RTL5Q5HYW3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RTL5Q5HYW3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RTL5Q5HYW3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RTL5Q5HYW3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms