Protein–RNA interactions for Protein: Q4V321

GAGE13, G antigen 13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE13Q4V321 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GAGE13Q4V321 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GAGE13Q4V321 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GAGE13Q4V321 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GAGE13Q4V321 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GAGE13Q4V321 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GAGE13Q4V321 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GAGE13Q4V321 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GAGE13Q4V321 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GAGE13Q4V321 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GAGE13Q4V321 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAGE13Q4V321 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GAGE13Q4V321 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GAGE13Q4V321 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GAGE13Q4V321 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GAGE13Q4V321 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GAGE13Q4V321 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GAGE13Q4V321 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GAGE13Q4V321 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAGE13Q4V321 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAGE13Q4V321 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GAGE13Q4V321 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GAGE13Q4V321 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAGE13Q4V321 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GAGE13Q4V321 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GAGE13Q4V321 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms