Protein–RNA interactions for Protein: Q494W8

CHRFAM7A, CHRNA7-FAM7A fusion protein, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRFAM7AQ494W8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRFAM7AQ494W8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRFAM7AQ494W8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRFAM7AQ494W8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRFAM7AQ494W8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRFAM7AQ494W8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRFAM7AQ494W8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRFAM7AQ494W8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRFAM7AQ494W8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRFAM7AQ494W8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRFAM7AQ494W8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRFAM7AQ494W8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRFAM7AQ494W8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRFAM7AQ494W8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRFAM7AQ494W8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRFAM7AQ494W8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRFAM7AQ494W8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRFAM7AQ494W8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRFAM7AQ494W8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRFAM7AQ494W8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRFAM7AQ494W8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRFAM7AQ494W8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRFAM7AQ494W8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRFAM7AQ494W8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRFAM7AQ494W8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms