Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.46□□□□□ -0.57
LSO1Q3E827 YGR021WYGR021W 873 nt11.45□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 MCH5YOR306C 1566 nt11.44□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 BOR1YNL275W 1731 nt11.43□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 PCH2YBR186W 1695 nt11.42□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 YBR220CYBR220C 1683 nt11.42□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.41□□□□□ -0.58
LSO1Q3E827 YDL221WYDL221W 552 nt11.39□□□□□ -0.59
LSO1Q3E827 PTP1YDL230W 1008 nt11.37□□□□□ -0.59
LSO1Q3E827 SIS1YNL007C 1059 nt11.37□□□□□ -0.59
LSO1Q3E827 MET8YBR213W 825 nt11.36□□□□□ -0.59
LSO1Q3E827 SHU1YHL006C 453 nt11.32□□□□□ -0.6
LSO1Q3E827 CAC2YML102W 1407 nt11.32□□□□□ -0.6
LSO1Q3E827 SDH1YKL148C 1923 nt11.31□□□□□ -0.6
LSO1Q3E827 HOM6YJR139C 1080 nt11.3□□□□□ -0.6
LSO1Q3E827 CLB6YGR109C 1143 nt11.27□□□□□ -0.61
LSO1Q3E827 PAU21YOR394W 495 nt11.24□□□□□ -0.61
LSO1Q3E827 PAU22YPL282C 495 nt11.24□□□□□ -0.61
LSO1Q3E827 PIB2YGL023C 1908 nt11.21□□□□□ -0.61
LSO1Q3E827 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.2□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 SCC4YER147C 1875 nt11.2□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 IRC15YPL017C 1500 nt11.16□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 YCH1YGR203W 447 nt11.16□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 PET9YBL030C 957 nt11.16□□□□□ -0.62
LSO1Q3E827 ART5YGR068C 1761 nt11.14□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 YKL097CYKL097C 411 nt11.14□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 RKM5YLR137W 1104 nt11.14□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 GFD2YCL036W 1701 nt11.14□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 ARO7YPR060C 771 nt11.13□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 GIS3YLR094C 1509 nt11.11□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 MNP1YGL068W 585 nt11.11□□□□□ -0.63
LSO1Q3E827 ALG12YNR030W 1656 nt11.04□□□□□ -0.64
LSO1Q3E827 CUE1YMR264W 612 nt11□□□□□ -0.65
LSO1Q3E827 RTS2YOR077W 699 nt10.99□□□□□ -0.65
LSO1Q3E827 RPM1RPM1 483 nt10.98□□□□□ -0.65
LSO1Q3E827 TIR4YOR009W 1464 nt10.98□□□□□ -0.65
LSO1Q3E827 RTF1YGL244W 1677 nt10.95□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YOL037CYOL037C 354 nt10.94□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YNL195CYNL195C 786 nt10.92□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YSC84YHR016C 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YIL100WYIL100W 354 nt10.91□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YMR057CYMR057C 372 nt10.91□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 NPL3YDR432W 1245 nt10.9□□□□□ -0.66
LSO1Q3E827 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.87□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 YLR236CYLR236C 324 nt10.87□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 YJL152WYJL152W 360 nt10.84□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 YJR154WYJR154W 1041 nt10.84□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 PTK1YKL198C 1989 nt10.84□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 YHL050CYHL050C 2094 nt10.84□□□□□ -0.67
LSO1Q3E827 Q0010Q0010 387 nt10.8□□□□□ -0.68
LSO1Q3E827 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.8□□□□□ -0.68
LSO1Q3E827 RRT12YCR045C 1476 nt10.78□□□□□ -0.68
LSO1Q3E827 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.76□□□□□ -0.69
LSO1Q3E827 BOP3YNL042W 1191 nt10.74□□□□□ -0.69
LSO1Q3E827 HSP60YLR259C 1719 nt10.72□□□□□ -0.69
LSO1Q3E827 FRE6YLL051C 2139 nt10.72□□□□□ -0.69
LSO1Q3E827 NAR1YNL240C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 WHI5YOR083W 888 nt10.67□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 YOR139CYOR139C 393 nt10.67□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 REG2YBR050C 1017 nt10.66□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 HSL7YBR133C 2484 nt10.66□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 YLR281CYLR281C 468 nt10.65□□□□□ -0.7
LSO1Q3E827 DED1YOR204W 1815 nt10.62□□□□□ -0.71
LSO1Q3E827 IDH1YNL037C 1083 nt10.61□□□□□ -0.71
LSO1Q3E827 IMP2'YIL154C 1041 nt10.59□□□□□ -0.71
LSO1Q3E827 FMP52YER004W 696 nt10.55□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 PAB1YER165W 1734 nt10.55□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 NCP1YHR042W 2076 nt10.54□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 SPT8YLR055C 1809 nt10.54□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 CMP2YML057W 1815 nt10.54□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 HEL2YDR266C 1920 nt10.53□□□□□ -0.72
LSO1Q3E827 ARA2YMR041C 1008 nt10.52□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 GBP2YCL011C 1284 nt10.52□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 YFL054CYFL054C 1941 nt10.5□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 TCD2YKL027W 1344 nt10.49□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 RRD1YIL153W 1182 nt10.48□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 YLR122CYLR122C 378 nt10.46□□□□□ -0.73
LSO1Q3E827 PAM17YKR065C 594 nt10.45□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.44□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.44□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 URH1YDR400W 1023 nt10.43□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 DSK2YMR276W 1122 nt10.43□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 LCB1YMR296C 1677 nt10.42□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 LCP5YER127W 1074 nt10.42□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 PUS2YGL063W 1113 nt10.42□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 GLK1YCL040W 1503 nt10.41□□□□□ -0.74
LSO1Q3E827 PCM1YEL058W 1674 nt10.38□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 MET2YNL277W 1461 nt10.38□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 SIM1YIL123W 1431 nt10.36□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 SFP1YLR403W 2052 nt10.35□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 TOM20YGR082W 552 nt10.35□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 YAT1YAR035W 2064 nt10.34□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.34□□□□□ -0.75
LSO1Q3E827 YDR433WYDR433W 441 nt10.33□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.32□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.32□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.32□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.32□□□□□ -0.76
LSO1Q3E827 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.32□□□□□ -0.76
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