Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
UVSSAQ2YD98 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
UVSSAQ2YD98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UVSSAQ2YD98 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
UVSSAQ2YD98 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
UVSSAQ2YD98 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
UVSSAQ2YD98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UVSSAQ2YD98 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UVSSAQ2YD98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
UVSSAQ2YD98 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UVSSAQ2YD98 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
UVSSAQ2YD98 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
UVSSAQ2YD98 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
UVSSAQ2YD98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UVSSAQ2YD98 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
UVSSAQ2YD98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
UVSSAQ2YD98 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
UVSSAQ2YD98 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
UVSSAQ2YD98 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
UVSSAQ2YD98 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
UVSSAQ2YD98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
UVSSAQ2YD98 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
UVSSAQ2YD98 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
UVSSAQ2YD98 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
UVSSAQ2YD98 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
UVSSAQ2YD98 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
UVSSAQ2YD98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
UVSSAQ2YD98 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
UVSSAQ2YD98 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
UVSSAQ2YD98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UVSSAQ2YD98 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UVSSAQ2YD98 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
UVSSAQ2YD98 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UVSSAQ2YD98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
UVSSAQ2YD98 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
UVSSAQ2YD98 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
UVSSAQ2YD98 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
UVSSAQ2YD98 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
UVSSAQ2YD98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
UVSSAQ2YD98 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
UVSSAQ2YD98 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UVSSAQ2YD98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
UVSSAQ2YD98 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
UVSSAQ2YD98 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
UVSSAQ2YD98 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
UVSSAQ2YD98 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
UVSSAQ2YD98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UVSSAQ2YD98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UVSSAQ2YD98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
UVSSAQ2YD98 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
UVSSAQ2YD98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UVSSAQ2YD98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
UVSSAQ2YD98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UVSSAQ2YD98 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UVSSAQ2YD98 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UVSSAQ2YD98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
UVSSAQ2YD98 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
UVSSAQ2YD98 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
UVSSAQ2YD98 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UVSSAQ2YD98 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UVSSAQ2YD98 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UVSSAQ2YD98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms