Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPEL1Q2QD12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPEL1Q2QD12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPEL1Q2QD12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPEL1Q2QD12 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPEL1Q2QD12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPEL1Q2QD12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPEL1Q2QD12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPEL1Q2QD12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPEL1Q2QD12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPEL1Q2QD12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPEL1Q2QD12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPEL1Q2QD12 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPEL1Q2QD12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPEL1Q2QD12 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPEL1Q2QD12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPEL1Q2QD12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPEL1Q2QD12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPEL1Q2QD12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPEL1Q2QD12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPEL1Q2QD12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPEL1Q2QD12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPEL1Q2QD12 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPEL1Q2QD12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms