Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDK4Q16654 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDK4Q16654 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDK4Q16654 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDK4Q16654 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDK4Q16654 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDK4Q16654 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDK4Q16654 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDK4Q16654 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDK4Q16654 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDK4Q16654 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDK4Q16654 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDK4Q16654 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDK4Q16654 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDK4Q16654 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDK4Q16654 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDK4Q16654 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDK4Q16654 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDK4Q16654 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDK4Q16654 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDK4Q16654 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDK4Q16654 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDK4Q16654 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDK4Q16654 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDK4Q16654 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDK4Q16654 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDK4Q16654 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDK4Q16654 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDK4Q16654 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDK4Q16654 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDK4Q16654 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDK4Q16654 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDK4Q16654 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDK4Q16654 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDK4Q16654 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDK4Q16654 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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