Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRA6Q16445 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRA6Q16445 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABRA6Q16445 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GABRA6Q16445 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA6Q16445 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABRA6Q16445 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA6Q16445 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA6Q16445 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABRA6Q16445 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABRA6Q16445 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA6Q16445 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA6Q16445 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA6Q16445 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA6Q16445 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA6Q16445 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA6Q16445 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA6Q16445 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA6Q16445 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRA6Q16445 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA6Q16445 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRA6Q16445 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRA6Q16445 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA6Q16445 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA6Q16445 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRA6Q16445 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRA6Q16445 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRA6Q16445 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRA6Q16445 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRA6Q16445 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRA6Q16445 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRA6Q16445 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRA6Q16445 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRA6Q16445 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA6Q16445 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRA6Q16445 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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