Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNCBQ16143 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNCBQ16143 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNCBQ16143 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNCBQ16143 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNCBQ16143 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNCBQ16143 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNCBQ16143 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNCBQ16143 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNCBQ16143 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNCBQ16143 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNCBQ16143 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNCBQ16143 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNCBQ16143 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNCBQ16143 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNCBQ16143 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNCBQ16143 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNCBQ16143 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNCBQ16143 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNCBQ16143 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNCBQ16143 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNCBQ16143 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNCBQ16143 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNCBQ16143 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNCBQ16143 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCBQ16143 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNCBQ16143 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNCBQ16143 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SNCBQ16143 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNCBQ16143 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNCBQ16143 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNCBQ16143 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNCBQ16143 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNCBQ16143 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNCBQ16143 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNCBQ16143 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCBQ16143 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNCBQ16143 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNCBQ16143 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNCBQ16143 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCBQ16143 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCBQ16143 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNCBQ16143 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNCBQ16143 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNCBQ16143 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNCBQ16143 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNCBQ16143 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNCBQ16143 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNCBQ16143 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNCBQ16143 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNCBQ16143 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms