Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PMCHL1Q16048 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PMCHL1Q16048 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PMCHL1Q16048 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMCHL1Q16048 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMCHL1Q16048 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PMCHL1Q16048 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PMCHL1Q16048 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PMCHL1Q16048 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PMCHL1Q16048 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMCHL1Q16048 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMCHL1Q16048 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHL1Q16048 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMCHL1Q16048 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMCHL1Q16048 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms