Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRK1Q15835 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRK1Q15835 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRK1Q15835 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRK1Q15835 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRK1Q15835 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRK1Q15835 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRK1Q15835 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRK1Q15835 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRK1Q15835 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRK1Q15835 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRK1Q15835 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRK1Q15835 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRK1Q15835 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRK1Q15835 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRK1Q15835 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRK1Q15835 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRK1Q15835 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRK1Q15835 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRK1Q15835 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRK1Q15835 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRK1Q15835 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRK1Q15835 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRK1Q15835 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRK1Q15835 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRK1Q15835 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRK1Q15835 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRK1Q15835 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRK1Q15835 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRK1Q15835 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRK1Q15835 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms