Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRADDQ15628 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRADDQ15628 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRADDQ15628 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRADDQ15628 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRADDQ15628 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRADDQ15628 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRADDQ15628 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRADDQ15628 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRADDQ15628 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRADDQ15628 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRADDQ15628 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRADDQ15628 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRADDQ15628 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRADDQ15628 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRADDQ15628 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRADDQ15628 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRADDQ15628 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRADDQ15628 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRADDQ15628 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRADDQ15628 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRADDQ15628 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRADDQ15628 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRADDQ15628 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRADDQ15628 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRADDQ15628 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRADDQ15628 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRADDQ15628 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRADDQ15628 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRADDQ15628 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRADDQ15628 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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