Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCM1Q15154 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCM1Q15154 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCM1Q15154 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCM1Q15154 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCM1Q15154 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCM1Q15154 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCM1Q15154 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCM1Q15154 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCM1Q15154 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCM1Q15154 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCM1Q15154 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCM1Q15154 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCM1Q15154 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCM1Q15154 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCM1Q15154 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCM1Q15154 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCM1Q15154 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCM1Q15154 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCM1Q15154 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCM1Q15154 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCM1Q15154 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCM1Q15154 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCM1Q15154 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCM1Q15154 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCM1Q15154 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCM1Q15154 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCM1Q15154 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCM1Q15154 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCM1Q15154 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCM1Q15154 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCM1Q15154 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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PCM1Q15154 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCM1Q15154 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCM1Q15154 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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PCM1Q15154 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCM1Q15154 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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PCM1Q15154 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCM1Q15154 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCM1Q15154 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCM1Q15154 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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PCM1Q15154 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCM1Q15154 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCM1Q15154 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCM1Q15154 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCM1Q15154 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCM1Q15154 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCM1Q15154 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCM1Q15154 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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