Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HERPUD1Q15011 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERPUD1Q15011 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERPUD1Q15011 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD1Q15011 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD1Q15011 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD1Q15011 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD1Q15011 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD1Q15011 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD1Q15011 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERPUD1Q15011 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERPUD1Q15011 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD1Q15011 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERPUD1Q15011 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD1Q15011 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD1Q15011 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERPUD1Q15011 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERPUD1Q15011 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERPUD1Q15011 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERPUD1Q15011 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERPUD1Q15011 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERPUD1Q15011 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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