Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSPNQ14714 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SSPNQ14714 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSPNQ14714 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSPNQ14714 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSPNQ14714 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSPNQ14714 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSPNQ14714 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSPNQ14714 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSPNQ14714 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSPNQ14714 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSPNQ14714 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSPNQ14714 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSPNQ14714 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSPNQ14714 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSPNQ14714 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSPNQ14714 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SSPNQ14714 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSPNQ14714 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SSPNQ14714 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSPNQ14714 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SSPNQ14714 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSPNQ14714 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSPNQ14714 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SSPNQ14714 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSPNQ14714 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSPNQ14714 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSPNQ14714 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSPNQ14714 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSPNQ14714 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSPNQ14714 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSPNQ14714 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSPNQ14714 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSPNQ14714 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSPNQ14714 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSPNQ14714 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSPNQ14714 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SSPNQ14714 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSPNQ14714 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSPNQ14714 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSPNQ14714 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSPNQ14714 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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