Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SMC1AQ14683 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SMC1AQ14683 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SMC1AQ14683 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SMC1AQ14683 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SMC1AQ14683 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SMC1AQ14683 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SMC1AQ14683 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SMC1AQ14683 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SMC1AQ14683 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMC1AQ14683 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMC1AQ14683 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SMC1AQ14683 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SMC1AQ14683 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SMC1AQ14683 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SMC1AQ14683 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SMC1AQ14683 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SMC1AQ14683 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SMC1AQ14683 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SMC1AQ14683 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SMC1AQ14683 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SMC1AQ14683 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SMC1AQ14683 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SMC1AQ14683 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SMC1AQ14683 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SMC1AQ14683 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMC1AQ14683 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMC1AQ14683 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMC1AQ14683 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SMC1AQ14683 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMC1AQ14683 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SMC1AQ14683 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMC1AQ14683 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMC1AQ14683 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMC1AQ14683 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMC1AQ14683 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SMC1AQ14683 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMC1AQ14683 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMC1AQ14683 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMC1AQ14683 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC1AQ14683 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC1AQ14683 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC1AQ14683 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC1AQ14683 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC1AQ14683 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC1AQ14683 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SMC1AQ14683 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
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