Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HNF4GQ14541 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HNF4GQ14541 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF4GQ14541 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF4GQ14541 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HNF4GQ14541 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HNF4GQ14541 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HNF4GQ14541 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HNF4GQ14541 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HNF4GQ14541 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HNF4GQ14541 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNF4GQ14541 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNF4GQ14541 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNF4GQ14541 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNF4GQ14541 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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