Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPARCL1Q14515 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPARCL1Q14515 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPARCL1Q14515 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPARCL1Q14515 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPARCL1Q14515 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPARCL1Q14515 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPARCL1Q14515 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPARCL1Q14515 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPARCL1Q14515 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPARCL1Q14515 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPARCL1Q14515 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPARCL1Q14515 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPARCL1Q14515 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPARCL1Q14515 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPARCL1Q14515 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPARCL1Q14515 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPARCL1Q14515 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPARCL1Q14515 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPARCL1Q14515 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPARCL1Q14515 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPARCL1Q14515 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPARCL1Q14515 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPARCL1Q14515 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPARCL1Q14515 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPARCL1Q14515 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPARCL1Q14515 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPARCL1Q14515 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPARCL1Q14515 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPARCL1Q14515 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPARCL1Q14515 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPARCL1Q14515 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPARCL1Q14515 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPARCL1Q14515 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPARCL1Q14515 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPARCL1Q14515 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPARCL1Q14515 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPARCL1Q14515 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPARCL1Q14515 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPARCL1Q14515 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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