Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPRIN1Q14444 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPRIN1Q14444 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPRIN1Q14444 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPRIN1Q14444 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPRIN1Q14444 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPRIN1Q14444 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPRIN1Q14444 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPRIN1Q14444 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPRIN1Q14444 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPRIN1Q14444 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPRIN1Q14444 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPRIN1Q14444 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPRIN1Q14444 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPRIN1Q14444 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPRIN1Q14444 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPRIN1Q14444 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPRIN1Q14444 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPRIN1Q14444 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPRIN1Q14444 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPRIN1Q14444 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPRIN1Q14444 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPRIN1Q14444 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPRIN1Q14444 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPRIN1Q14444 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPRIN1Q14444 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPRIN1Q14444 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN1Q14444 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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