Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CNGB1Q14028 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CNGB1Q14028 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CNGB1Q14028 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CNGB1Q14028 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CNGB1Q14028 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CNGB1Q14028 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CNGB1Q14028 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CNGB1Q14028 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CNGB1Q14028 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CNGB1Q14028 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CNGB1Q14028 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CNGB1Q14028 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CNGB1Q14028 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CNGB1Q14028 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CNGB1Q14028 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CNGB1Q14028 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CNGB1Q14028 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CNGB1Q14028 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
CNGB1Q14028 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CNGB1Q14028 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CNGB1Q14028 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CNGB1Q14028 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CNGB1Q14028 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CNGB1Q14028 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CNGB1Q14028 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CNGB1Q14028 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CNGB1Q14028 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
CNGB1Q14028 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CNGB1Q14028 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CNGB1Q14028 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
CNGB1Q14028 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CNGB1Q14028 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CNGB1Q14028 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CNGB1Q14028 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CNGB1Q14028 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CNGB1Q14028 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CNGB1Q14028 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CNGB1Q14028 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CNGB1Q14028 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CNGB1Q14028 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNGB1Q14028 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNGB1Q14028 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CNGB1Q14028 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CNGB1Q14028 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CNGB1Q14028 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CNGB1Q14028 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CNGB1Q14028 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CNGB1Q14028 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CNGB1Q14028 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CNGB1Q14028 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CNGB1Q14028 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CNGB1Q14028 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CNGB1Q14028 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNGB1Q14028 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CNGB1Q14028 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CNGB1Q14028 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CNGB1Q14028 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CNGB1Q14028 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CNGB1Q14028 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CNGB1Q14028 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CNGB1Q14028 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CNGB1Q14028 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CNGB1Q14028 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
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