Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1DQ13901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1DQ13901 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1DQ13901 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1DQ13901 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1DQ13901 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1DQ13901 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1DQ13901 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1DQ13901 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1DQ13901 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1DQ13901 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1DQ13901 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1DQ13901 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1DQ13901 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1DQ13901 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1DQ13901 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1DQ13901 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1DQ13901 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1DQ13901 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1DQ13901 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1DQ13901 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1DQ13901 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1DQ13901 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1DQ13901 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1DQ13901 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1DQ13901 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1DQ13901 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C1DQ13901 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1DQ13901 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1DQ13901 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1DQ13901 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1DQ13901 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1DQ13901 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1DQ13901 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1DQ13901 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1DQ13901 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1DQ13901 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1DQ13901 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1DQ13901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1DQ13901 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1DQ13901 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1DQ13901 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1DQ13901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1DQ13901 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1DQ13901 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1DQ13901 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1DQ13901 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1DQ13901 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1DQ13901 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1DQ13901 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1DQ13901 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
C1DQ13901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1DQ13901 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1DQ13901 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1DQ13901 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
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