Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1DQ13901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1DQ13901 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1DQ13901 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1DQ13901 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1DQ13901 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1DQ13901 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1DQ13901 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1DQ13901 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1DQ13901 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1DQ13901 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1DQ13901 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1DQ13901 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1DQ13901 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1DQ13901 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1DQ13901 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1DQ13901 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1DQ13901 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1DQ13901 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1DQ13901 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1DQ13901 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1DQ13901 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1DQ13901 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1DQ13901 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1DQ13901 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1DQ13901 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1DQ13901 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1DQ13901 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1DQ13901 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1DQ13901 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1DQ13901 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1DQ13901 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1DQ13901 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C1DQ13901 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1DQ13901 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1DQ13901 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1DQ13901 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1DQ13901 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1DQ13901 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1DQ13901 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1DQ13901 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1DQ13901 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1DQ13901 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1DQ13901 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1DQ13901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1DQ13901 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1DQ13901 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1DQ13901 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1DQ13901 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1DQ13901 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1DQ13901 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1DQ13901 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1DQ13901 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1DQ13901 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1DQ13901 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1DQ13901 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1DQ13901 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1DQ13901 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1DQ13901 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C1DQ13901 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1DQ13901 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
C1DQ13901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1DQ13901 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C1DQ13901 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1DQ13901 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1DQ13901 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1DQ13901 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1DQ13901 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms