Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A4Q13733 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A4Q13733 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A4Q13733 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP1A4Q13733 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP1A4Q13733 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP1A4Q13733 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1A4Q13733 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1A4Q13733 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP1A4Q13733 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP1A4Q13733 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP1A4Q13733 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP1A4Q13733 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP1A4Q13733 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP1A4Q13733 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP1A4Q13733 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP1A4Q13733 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP1A4Q13733 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP1A4Q13733 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP1A4Q13733 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP1A4Q13733 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP1A4Q13733 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP1A4Q13733 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP1A4Q13733 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP1A4Q13733 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A4Q13733 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP1A4Q13733 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A4Q13733 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
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