Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MADCAM1Q13477 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MADCAM1Q13477 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MADCAM1Q13477 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MADCAM1Q13477 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MADCAM1Q13477 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MADCAM1Q13477 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MADCAM1Q13477 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MADCAM1Q13477 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MADCAM1Q13477 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MADCAM1Q13477 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MADCAM1Q13477 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MADCAM1Q13477 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MADCAM1Q13477 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MADCAM1Q13477 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MADCAM1Q13477 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MADCAM1Q13477 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MADCAM1Q13477 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MADCAM1Q13477 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MADCAM1Q13477 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MADCAM1Q13477 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MADCAM1Q13477 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MADCAM1Q13477 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MADCAM1Q13477 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MADCAM1Q13477 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MADCAM1Q13477 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MADCAM1Q13477 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MADCAM1Q13477 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MADCAM1Q13477 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MADCAM1Q13477 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MADCAM1Q13477 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MADCAM1Q13477 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MADCAM1Q13477 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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