Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MRPL49Q13405 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL49Q13405 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL49Q13405 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL49Q13405 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL49Q13405 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MRPL49Q13405 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MRPL49Q13405 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MRPL49Q13405 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MRPL49Q13405 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MRPL49Q13405 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRPL49Q13405 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL49Q13405 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL49Q13405 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL49Q13405 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPL49Q13405 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPL49Q13405 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPL49Q13405 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPL49Q13405 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPL49Q13405 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL49Q13405 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL49Q13405 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms