Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX3Q13185 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX3Q13185 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX3Q13185 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX3Q13185 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX3Q13185 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX3Q13185 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX3Q13185 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX3Q13185 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX3Q13185 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX3Q13185 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX3Q13185 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX3Q13185 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX3Q13185 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBX3Q13185 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBX3Q13185 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBX3Q13185 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBX3Q13185 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX3Q13185 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX3Q13185 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX3Q13185 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX3Q13185 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX3Q13185 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX3Q13185 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX3Q13185 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX3Q13185 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX3Q13185 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX3Q13185 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1038.9 ms