Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHAF1AQ13111 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHAF1AQ13111 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHAF1AQ13111 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CHAF1AQ13111 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CHAF1AQ13111 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHAF1AQ13111 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHAF1AQ13111 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHAF1AQ13111 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CHAF1AQ13111 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHAF1AQ13111 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHAF1AQ13111 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHAF1AQ13111 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHAF1AQ13111 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHAF1AQ13111 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHAF1AQ13111 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHAF1AQ13111 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CHAF1AQ13111 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHAF1AQ13111 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CHAF1AQ13111 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CHAF1AQ13111 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CHAF1AQ13111 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CHAF1AQ13111 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CHAF1AQ13111 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CHAF1AQ13111 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHAF1AQ13111 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHAF1AQ13111 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHAF1AQ13111 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHAF1AQ13111 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHAF1AQ13111 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHAF1AQ13111 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHAF1AQ13111 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CHAF1AQ13111 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CHAF1AQ13111 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CHAF1AQ13111 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CHAF1AQ13111 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHAF1AQ13111 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHAF1AQ13111 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHAF1AQ13111 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHAF1AQ13111 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CHAF1AQ13111 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHAF1AQ13111 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CHAF1AQ13111 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHAF1AQ13111 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CHAF1AQ13111 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHAF1AQ13111 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CHAF1AQ13111 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CHAF1AQ13111 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CHAF1AQ13111 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHAF1AQ13111 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHAF1AQ13111 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHAF1AQ13111 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHAF1AQ13111 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CHAF1AQ13111 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHAF1AQ13111 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHAF1AQ13111 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHAF1AQ13111 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHAF1AQ13111 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CHAF1AQ13111 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CHAF1AQ13111 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHAF1AQ13111 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHAF1AQ13111 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHAF1AQ13111 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHAF1AQ13111 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHAF1AQ13111 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHAF1AQ13111 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHAF1AQ13111 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHAF1AQ13111 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHAF1AQ13111 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHAF1AQ13111 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
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