Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BNIP1Q12981 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BNIP1Q12981 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BNIP1Q12981 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BNIP1Q12981 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BNIP1Q12981 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BNIP1Q12981 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BNIP1Q12981 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BNIP1Q12981 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BNIP1Q12981 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BNIP1Q12981 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BNIP1Q12981 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BNIP1Q12981 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BNIP1Q12981 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BNIP1Q12981 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BNIP1Q12981 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP1Q12981 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BNIP1Q12981 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BNIP1Q12981 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BNIP1Q12981 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNIP1Q12981 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BNIP1Q12981 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BNIP1Q12981 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BNIP1Q12981 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BNIP1Q12981 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BNIP1Q12981 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BNIP1Q12981 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BNIP1Q12981 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BNIP1Q12981 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP1Q12981 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BNIP1Q12981 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BNIP1Q12981 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BNIP1Q12981 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BNIP1Q12981 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BNIP1Q12981 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BNIP1Q12981 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BNIP1Q12981 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BNIP1Q12981 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BNIP1Q12981 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BNIP1Q12981 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BNIP1Q12981 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BNIP1Q12981 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BNIP1Q12981 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BNIP1Q12981 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BNIP1Q12981 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BNIP1Q12981 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms