Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FOXD4Q12950 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXD4Q12950 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD4Q12950 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXD4Q12950 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXD4Q12950 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXD4Q12950 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4Q12950 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4Q12950 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4Q12950 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FOXD4Q12950 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4Q12950 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4Q12950 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXD4Q12950 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXD4Q12950 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXD4Q12950 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms